高端新冠疫苗從疫情爆發至今爭議不斷，除採購合約遭質疑外，近日更傳出，高端疫苗僅有第1批號出來後有做檢驗。食藥署回應，共受理高端公司申請45批、566萬4,743劑新冠肺炎疫苗檢驗封緘案，每批疫苗在派員赴倉儲現場查核取樣後，皆送回國家實驗室進行外觀、鑑別、pH值、鋁含量、CpG含量、無菌試驗、細菌內毒素試驗、總蛋白含量、異常毒性試驗、抗原含量及效價等11項檢驗，直到檢驗與審查皆合格後，才會核發封緘證明書放行封緘。

疾管署今（17）日表示，針對昨日公開高端COVID-19疫苗採購契約後，各界所提相關疑問，包括為何高端疫苗還未通過EUA，就和疾管署完成議價與簽約，以及為何在通過EUA後，就於隔天簽署保密合約等8大疑慮。

台灣雖已進入新冠肺炎後疫情時代，但國內對於高端疫苗爭議仍是餘波蕩漾，臺大醫院與台灣醫學會8日舉辦高峰論壇記者會，疾管署署長莊人祥表示，衛福部著手編撰「後疫情時代防疫白皮書」，將口罩、疫苗到快篩試劑等防疫物資維持一定自製量能，視為重大方針，此外，強調高端疫苗雖未完成3期臨床，但這不是大挫敗。

多間液蛋廠將進口雞蛋製成的液蛋產地標示為「台灣」，標示不實，引發消費者疑慮。為此，立法院要求農業部提供相關標示不實蛋品流向資料，衛福部食藥署則依此進行稽查，上午公布報告，食藥署副署長林金富表示，確認相關產品品質沒問題，也無其他標示錯誤情況。此外，國民黨黨員質疑，高端疫苗在台臨床試驗不全，安全性與療效仍有疑慮，對此，食藥署也提出回應。

有關近期流感疫苗相關爭議，疾管署今（5）日再次說明，公費流感疫苗均已取得國內藥品許可證，採購方式係由專家組成採購評選委員會進行評選審核後完成採購，採購程序皆符合政府採購法規範。

隨著新冠疫情升溫，疾管署表示，10月起COVID-19病例數明顯增加，預計12月底達到高峰，屆時每天約新增2萬例病例，為做好防疫準備。疾管署發言人曾淑慧今（3）日在記者會上也宣布，10月11日起開放全民施打莫德納XBB疫苗，不再侷限於老年人及醫護人員等族群。

腸病毒71型來勢洶洶，1998年國內曾大爆發，累計14兒童通報確診，405例重症、其中78例死亡，歷年重症致死率逾3成。而今年腸病毒疫情再起，單週就診人次接連數週飆破萬人，創近6年同期新高，腸病毒71型作為國內主要流行病毒株不可不防。高端疫苗生物製劑股份有限公司歷經10年研發，高端腸病毒71型疫苗於今年8月上市，目前雖屬自費施打，但專家呼籲，腸病毒治療無特效藥，因此打疫苗是很重要的預防措施。

世界衛生組織（WHO）於台灣時間2023年9月6日晚間9時召開例行記者會，總幹事譚德賽博士（Dr. Tedros）在會中提及高端疫苗授權COVID-19疫苗技術將授予WHO計畫單位C-TAP（COVID 19 Technology Access Pool）與聯合國公衛組織單位（Medicines Patent Pool, MPP），未來如再授權予第3方，高端可再收取合理且可負擔之授權金，以促進疫苗製造技術全球廣泛應用。高端公司經技術專家評估獲選為全球首家參與WHO C-TAP及聯合國MPP計畫之疫苗製造商，盼能攜手國際組織共同推動全球新冠疫苗的廣泛使用。