公費流感疫苗政策行之多年，疾病管制署宣布，明年起將有重大改革，長照、安養等機構長輩改打「加強型」流感疫苗，以強化保護力。另有兩項公費疫苗新政策，採購新版成人肺炎鏈球菌疫苗，只要接種一劑，預計1月15日起開打，另調升疫苗接種處置費。

美國疾病管制中心（CDC）預防接種諮詢委員會（ACIP）於2025年12月5日以8比3通過修訂建議，將原先「新生兒須於出生24小時內接種B型肝炎疫苗」的規範，改為針對由B型肝炎表面抗原（HBsAg）陰性母親所生的新生兒，採「個人化決策」，由父母與醫療人員依風險評估共同討論是否接種，並建議若未在出生當下接種，則可延後至出生滿2個月再施打第1劑。對此，疾管署已在諮詢ACIP專家後，決定「不跟進」，仍維持我國現行新生兒出生時全面接種B型肝炎疫苗的政策。

國內爆發百日咳群聚感染，指標個案為1個月大的男嬰，8月中旬出現咳嗽症狀，因食慾下降、尿量減少、呼吸急促，而緊急就醫，住進加護病房，下旬確診百日咳。疫調發現，男嬰的媽媽、姊姊均有咳嗽症狀，9月初檢驗結果陽性，同樣確診，屬家庭群聚事件。

隨著氣溫攀升，夏季蚊蟲活動進入高峰期，除了惱人的叮咬發癢外，更需要警惕的是蚊媒傳染病的威脅。根據衛生福利部疾病管制署最新統計，截至今年7月底，全國已累計19例日本腦炎確定個案，其中2例死亡，而每年6至7月正是日本腦炎的流行高峰期。

113年臺北市死亡人數計1萬9,734人，較112年減少821人（-4.0%），主要因嚴重特殊傳染性肺炎（COVID-19）死亡減少754人（-72.3%）所致。死亡率為每十萬人788.9人，下降34.5人（-4.2%）。排除人口老化因素的標準化死亡率為每十萬人307.4人，下降6.5%。

目前新冠疫苗屬公費疫苗，幾乎為全民皆可接種，但疾管署今天宣布，114年秋冬公費新冠疫苗接種對象不再為「年滿6個月以上所有民眾」，而是調整為10類對象，至 10月1日起，6歲至49歲等健康民眾不在公費新冠疫苗接種範圍。

美國衛生部長小羅勃甘迺迪（Robert F. Kennedy Jr.）宣布，不建議孕婦、健康兒童接種COVID疫苗。而這項重大公衛措施跳過美國疾病管制暨預防中心（CDC）傳統建議程序，截至目前為止，美國CDC網站仍未公告此事。

疾管署今（15）日公布國內新增1起麻疹群聚事件及2例境外移入麻疹個案。該起群聚感染事件為2名未滿1歲男嬰，皆曾於3月24日與境外移入個案有相同活動史，分別於4月3日及4月4日出現發燒、流鼻涕等症狀，經就醫採檢於4月11日確診，此為國內今（2025）年第2起境外移入個案致本土群聚事件。本起群聚事件累計確診3例，衛生單位已掌握2名男嬰相關接觸者共524名，預計監測至4月25日。另新增2例境外移入個案分別為中部1歲多男童及北部30多歲女性。2名個案均有越南旅遊史（分別至金甌省和富國島）返國後發病，經就醫通報檢驗確診。