近期重複感染的議題受到熱烈討論，指揮中心表示修改重複感染定義，將距離上次發病1到3個月內，放寬為14到3個月內。而未來經醫師通報疑似重複感染，就會自動通報為確診。

中央流行疫情指揮中心今（29）日表示，經持續監測國際及國內疫情，疫情正以穩定可控方向發展，在評估國內防疫與醫療量能後，為邁向正常生活，自10月13日的0時（航班表定抵台時間）起，入境人員免除居家檢疫，進行「7天自主防疫」，並開放相關邊境管制措施，以兼顧防疫、經濟、維持社會運作及國際交流之需求。

中央流行疫情指揮中心在今（26）日宣布將從10月1日起贈送5劑家用快篩給65歲以上年長者，0到6歲幼兒也可領取5劑快篩。同時考量民眾可能有大量使用快篩的需求，10月起新1輪實名制快篩，每人最高可買30劑。

在歷經新冠肺炎疫情後，民眾對流感威脅及其併發症警覺性稍有降低。其實自2020年至今，流感流行季節內流感幾乎消失無蹤，大部分人對於流感的抵抗力都弱，尤其在新冠肺炎仍未停歇下，若連流感病毒也一起流行，勢必讓醫療負擔更加嚴峻。有研究發現，施打流感疫苗後，發生腦中風、心肌梗塞的機率有減少，且接種流感疫苗除了能預防感染流感病毒外，也可避免肺炎、腦炎等併發症的產生，更可預防心血管疾病。孕婦也可接種，目前已有間接證據顯示，孕婦若得到流感，對胎兒健康影響大，可能會令器官功能出現異常，甚至包括腦部發育也會受影響。

9月1日起有多項防疫新規定，包含：入境者可自駕前往檢疫處進行3+4，後4天只要1人1室即可；如果同住家人同時入境也可多人1室。第5輪快篩實名制也上路。

中央流行疫情指揮中心今（31）日表示，國內持續出現社區BA.5感染個案且疫情明顯上升，加上近期學校已開學及中秋連假將至，民眾交流及聚會機會增加，社區傳播風險上升，為因應民眾購買家用抗原快篩試劑之需求，宣布自9月1日起，實施第5輪家用抗原快篩試劑實名制。

中央流行疫情指揮中心今（25）日表示，因應疫情上升，為加強有症狀長者篩檢，並及早用藥，自9月1日起，民眾可持65歲以上長者（1957年以前出生）健保卡，至各快篩實名制販售據點免費領取1份5劑家用快篩試劑，以提供長者更足量的家用抗原快篩試劑。

中央流行疫情指揮中心在今（24）日宣布新增28,397例本土個案，指揮中心指揮官王必勝表示，下周單日確診人數將突破3萬例，呼籲尚未接種疫苗的兒童盡快施打疫苗。指揮中心醫療應變組副組長羅一鈞也坦言，「重複感染」是下一波疫情的重要特徵，因BA.5免疫逃脫的特性，可能感染過BA.1、BA.2的人將感染到BA.5，且自7月份通報重複感染個案為2500多位，占目前確診的「萬分之五」，預計人數將持續增加。