外界傳出政府將於明年逐漸取消愛滋病患的藥物給付，不過，疾管局強調，未來愛滋病毒感染者就醫，將比照現行健保就醫部分負擔方式與額度來執行，部分經濟弱勢個案的免部分負擔方式，也不會改變。
疾管局副局長施文儀指出，最近網路上部分愛滋病毒感染者對於規劃中愛滋病醫療部分負擔實施的方式與時程，有所不瞭解，以致出現了不實謠傳。
為了避免造成大眾愛滋病毒感染者的誤解與恐慌，疾病管制局已正式發函指定醫院、民間團體及縣市衛生局予以澄清，愛滋病患就醫院權益不會受到傷害。
我國自民國86年開始，即由政府提供雞尾酒療法（HAART）免費醫療，使得大部份的愛滋病毒感染者可獲得妥善治療，不僅愛滋感染者的發病率及致死率明顯下降，同時隨著病患生活品質。
不過，愛滋患者存活年數逐漸延長，整個醫療費用也逐年遞增，目前確實形成政府嚴重負擔。但考量執行部分負擔後，恐有部分個案遭遇臨時突發或特殊狀況繳不起該項費用，疾病管制局業於99年12月30日，邀請愛滋相關團體代表共同討論，研擬相關配套措施。
例如，未成年個案、經濟困難個案及住院等個案的部分負擔費用，傾向由配套措施另給予補助。疾管局將持續收集各方意見，作為規劃相關配套措施參考。
至於有關執行部分負擔時程，仍需於疾管局研擬相關配套措施完成，並與健保局進行細部作業討論後再實施，但一定會先進行相關宣導，正式實施日期則以該局公告為主。
對於醫療費用不斷增加，疾管局規劃多元方案作為因應，除持續努力避免新發個案產生外，在降低藥價之規畫上，從於99年7月對部分藥物進行調降，預估一年可減少3000萬元藥費。
未來疾管局將定期隨著健保局藥價調整作業進行調整，並在兼顧藥物品質下，引進過專利期的學名藥物，除確保病人權益，並達到降低醫療成本的目的。
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