颱風造成台灣南部各地嚴重水災，衛生署提醒，目前正值酷夏，溫度偏高，淹水之後，如果沒有注意環境的消毒與清潔，以及個人的衛生，黴菌、細菌等致病原將迅速滋生，影響人體健康。
有鑑於此，衛生署要求各縣市衛生局加強餐飲衛生稽查，尤其注意飲水衛生與食材保存使用，以確保災民不受二次傷害。沒有良好水源及廁所無法經常性保持清潔的餐飲業者應暫停營業，以避免交叉汙染造成食品中毒發生。
另外，餐飲業者在製作食物之前，應將手部洗乾淨，勤洗手，以杜絕傳染。如果新鮮食品遭到水淹，為確保安全，應丟棄，不要食用。要是一定要吃，務必以清潔的自來水洗淨後，再用沸水充分煮熟過，才能食用。
停電地區，為確保飲食安全，冰箱內不應再食用。魚貝類食材若未經適當條件保存，易造成腐敗而引起組織胺中毒，不可以供人食用。餐飲業者不要供應生食，食物應充分煮熟。
災民應特別注意刀、砧板、容器、鍋、盤的清潔與衛生，以防汙染，必要時用沸水沖洗後使用。萬一發生食物中毒事件，除立即送醫外，應立即通知衛生單位前往調查處理。
值得注意的是，稀釋過後的漂白水味道較淡，與一般開水差不多。民眾一定要在包裝瓶上黏貼上警語或標示，或以不褪色筆書寫，以避免誤食。
在飲用水的衛生方面，衛生署強調，飲用水一定要煮沸後才能飲用，不可生飲自來水、井水，或溪水等天然水源的水；停水期間應關閉抽水馬達，以免造成管路負壓，導致輸水系統受到污染之情形。
限水期間應使用自來水或市售GMP標誌包裝飲用水，並應在有效日期內。如未經檢驗合格的地下水源，請勿飲用。如處於特殊情況，須飲用地下水，要先消毒、煮沸後，始能使用。
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