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台灣感染症醫學會、台灣疫苗推動協會表示，新VIEW的預防觀點即Vaccination 疫苗、Information資訊、Exercise運動及Wash Hand洗手，更提醒家長應在暑假期間為兒童施打疫苗提升免疫力，以免秋冬受到「二毒(新流感、一般流感)一菌(肺炎鏈球菌)」的危害。
隨著流感疫情發生，國內外也越來越重視疫苗的預防觀念，行政院衛生署疾病管制局施文儀副局長表示，政府已全力投入新流感疫苗的研發、製作及採購，預計10月份可提供國人接種。台灣疫苗推動協會理事長李慶雲醫師樂見預防重於治療的觀念已廣被接受，尤其對新型流感來說，民眾體內幾乎完全沒有抗體，更應利用有效的疫苗以降低感染傷害。
目前國內已積極儲備新型流感疫苗，但仍需三個多月的準備時間。在這段期間內，李慶雲理事長提醒國人，特別是幼童及年長者等高危險族群，應及早預防秋冬季節性流感及流感併發細菌性肺炎可能帶來的另一波疫情。盡快接種流感疫苗、肺炎鏈球菌疫苗等，才能在秋冬季節性流感來臨前，讓疫苗產生保護力。而在未來新流感疫苗上市時也應再施打，透過三種疫苗的保護分別降低「二毒一菌」的威脅，以便全面降低感染率及重症比率。
台灣感染症醫學會理事長林奏延醫師指出，雖然現階段新流感疫情處於全球溫和大流行，但WHO仍建議各國在大流行期間應持續監測疫情發展，政府也應為人民提供指導，幫助國人能夠保護自己及家人，秉持著預防重於治療的防治重點，做好基本藥物、設備、抗病毒藥物及疫苗的準備計畫。
林奏延理事長從H1N1全球通報現況發現，因多數人對新病毒不具有抵抗力，H1N1可能會比季節性流感造成更大範圍的感染，各界紛紛擔憂H1N1這個具有高度傳染力的新病毒，除了病毒本身原有的突變能力外，若再加上其他因素，可能會改變目前疾病的嚴重程度，例如當新流感病毒傳播到南半球且遇到目前現有的流感病毒時，可能會發生各種變化；或新流感病毒與H5N1禽流感病毒可能在某些地區產生交互感染等，這些因素都會增加出現更強病毒可能性。
台灣疫苗推動協會副秘書長呂俊毅醫師解讀秋冬另一波大流行的主要威脅是在於二次感染提高了致死率，無論是流感病毒或N1H1新流感病毒與高抗藥性的肺炎鏈球菌之交互感染對死亡率有加乘的效果。林奏延理事長指出，台塑集團前王董事長於前年捐贈23價多醣體肺炎鏈球菌疫苗57萬劑，供全國75歲以上老年人免費接種，相信在秋冬H1N1流感大流行發生時台灣的死亡率預期可較其他國家低，有鑑於幼童也是高危險族群，應鼓勵提早接種結合型肺炎鏈球菌疫苗。
面臨秋冬另一波新流感、季節性流感及肺炎鏈球菌之交互感染的威脅，台灣疫苗推動協會秘書長、台灣感染症醫學會發言人李秉穎醫師建議，由於新流感與季節性流感的臨床症狀極為類似，診斷上難以分辨，為達到保護效果並減少防疫所需的社會成本，建議無論是針對新流感或季節性流感，或是為了降低併發細菌感染後可能帶來的死亡威脅，可考慮全面施打各種疫苗作為預防另一波大流行有效的選擇。在新流感及季節性流感疫苗尚未到位的情形下，目前有肺炎鏈球菌疫苗可供施打。
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