隨著各國邊境開放，近期出國人數不斷增加，中央流行疫情指揮中心表示，「數位新冠病毒健康證明」（以下稱數位證明）之疫苗數位證明下載數有增加趨勢，提醒民眾數位證明與外交部領事事務局之間的護照資料自動交換機制並非及時更新，因此建議提前做好準備工作。

中央流行疫情指揮中心指揮官王必勝表示，疫情有反轉跡象，冬季是呼吸道疾病好發時期，防疫措施鬆綁以及年關將近，餐飲交流頻繁，這些都會增加傳染機會；另因中國疫情升溫，對我國多少會有影響。

近日有項網路謠言，指出有中國媒體報導，Omicron的變異株BA.5的子代變異株BQ.1的傳染力與致死率很高，甚至還幫這病毒取了個「地獄犬」之暱稱；中央流行疫情指揮中心澄清為不實訊息：BQ.1傳染力確實偏高，但致死率沒有更高，且BA.5次世代疫苗追加劑有助感染BA.5變異株時，降低重症或死亡的風險。

中央流行疫情指揮中心今（28）日公布，國內新增85例Omicron亞型變異株確定病例，分別為64例本土個案（60例BA.5、3例BA.2.75、1例BA.2）及21例境外移入（10例BA.5、4例BA.2.75、5例XBB、2例BQ.1）。截至目前國內今（2022）年累計檢出之Omicron亞型變異株境外移入確定病例：XBB為15例、BF.7為4例、BQ.1為9例、BA.5為1,246例、BA.4為104例、BA.2.75為81例、BA.2為1,028例；另累計本土確定病例XBB為1例、BF.7為1例、BQ.1為2例、BA.5為1,325例、BA.4為5例、BA.2.75為3例、BA.2為2,530例。

中央流行疫情指揮中心在今（21）日宣布國內最新的病毒基因定序結果，尚未驗出新興變異株入侵社區的本土個案，然檢出102例的Omicron病毒基因定序，為81例本土個案與21例的境外移入個案等。境外部分21例，發現僅一半的BA.5，而BA.2.75過去3週從6%升高到28%，且提升到43%，可能蓋過BA.5成為主流株。

疾管署14日表示，111年度公費流感疫苗所有接種對象現在已全部開打，截至11月13日止，629萬劑公費流感疫苗已使用超過514萬劑，整體使用率已逾8成，疾管署呼籲65歲以上長者及學齡前幼兒等高風險族群儘快接種。

中央流行疫情指揮中心今（31）日公布國內病毒基因定序結果，在南北2地檢出BF.7、XBB首例本土病例，2人已接種3劑疫苗，更發現其中1位北部40多歲男性是重複感染。

食藥署在10月26日召開專家會議，討論BNT（BioNTech） BA.1及BA.4／5雙價疫苗與莫德納（Moderna） BA.4／5雙價疫苗之專案輸入申請案。最後決議， Moderna BA.4／5雙價疫苗之專案輸入，適用於12歲以上青少年及成人之主動免疫接種。