腸躁症成因多元，可能為壓力、情緒問題、睡眠不正常、腸道菌叢異常、腸道發炎或感染、飲食習慣不佳等有關；2017年《Nutrients》研究指出，腸躁症發生與西方飲食型態（高油脂、高精緻糖攝取）有正相關，另1項2018年發表的研究則指出，膳食纖維攝取較高者，腸躁症發生率較低。
腸躁症治療趨勢除了以藥物緩解及紓解壓力，還有國人較少接觸的「低腹敏3階段飲食」Low FODMAP diet（Low Fermentable Oligosaccharides Disaccharides Monosaccharides And Polyols）；食物FODMAP高低取決於個體對該食物的腸道敏感度。對腸躁症患者來說，若FODMAP攝取過多而無法被小腸完全吸收，直接進入大腸，帶入水分造成腹瀉，或經過腸道細菌發酵後產生氣體引起腹脹、腹痛。
「低腹敏飲食」並非只是避免攝取特定食物，而是必須在醫師、營養師建議之下分3階段進行，以找出患者對個別食物腹敏狀況，提出相應之飲食建議：另外也提醒，採取低腹敏飲食，可能會減少蔬果雜糧類的攝取，長期使用可能會造成營養失衡，故一般健康人在無腸道症狀時也不建議採取此方法，而特殊對象如：幼兒、老人、飲食不正常者也不適用。
攝取水果類其多酚可抑制腸道內病原體滋長並促進益生菌生長，更可能進一步與維生素C交互作用，協同抑制病原體（如金黃色葡萄球菌、變形鏈球菌、沙門氏菌等）；而其未經腸道消化反應的醣類，可作為益生元刺激腸道後段益生菌生長或活化，或是經過共生菌群發酵作用後，選擇性促進益菌生長。故可選擇富含水溶性纖維、維生素C、多酚的水果，如：柑橘類、番茄、木瓜、奇異果等，有助於建立腸道好菌相。
董氏基金會從預防角度提醒，平時應努力為腸道益生菌創造良好的生長環境，建立好的腦-腸軸功能；提醒國人宜攝取足量蔬果，建立腸道好的菌相，打好根基，以遠離遠離腸躁威脅。
