為了平息眾怒，讓毒奶事件風暴盡速到一段落，衛生署長林芳郁昨天中午請辭，成為衛生署歷任署長中，任期最短的署長，任期只有一百二十九天。
林芳郁語氣平穩地說，前一天晚上決定制訂「三聚氰胺」容許量2.5PPM時，就有準備要請辭的心理準備，當晚就告訴了妻子（國內知名整形外科醫師）林靜芸，自己的打算，因為他覺得「誠信」最重要。
不過，林芳郁強調，在制訂「三聚氰胺」容許量標準的時間點上，確實有瑕疵，但是如果現在沒有做，日後會更難收拾，一定要要從源頭收拾起。
林芳郁指出，食品中的三聚氰胺標準值，從零提高至2.5ppm ，是由他拍板定案，目的是讓國內所有實驗室檢驗作業以及日後食品進口抽驗，都有統一數值。
林芳郁表示，政府在處理毒奶粉一案，包括衛生署的政策，都是以食品安全、民眾健康作為最高原則，目前國內販售所有奶粉都是安全的，請民眾不用擔心。
凡食品成分中，含有來自大陸製造的植物性蛋白，奶精與乳製品成分者的奶粉、奶製品都已一律下架，讓民眾吃得安心，檢驗合格才能上架的原則是不會改變的，未來上架的都是合格的。
林芳郁說，以往三聚氰胺並無沒有國家管理標準，因為它並不可以添加在食物中，這次衛生署為了爭取時效，委由多家檢驗機構，以致檢查結果不一，讓民眾產生疑慮。
林芳郁強調，因為檢查結果不一，而造成民眾的恐慌、無所適從，他個人願意負起全部責任，因為所有指令都是他決定的，他已經向行政院長提出辭呈，以表示負責。
儘管林芳郁請辭表示負責，不過，還是有不少學者跳出來抨擊衛生署這項措施，中原大學生物科技系主任蔡敬民就連說了幾句「這太過份了！」來表達心中不滿。
蔡敬民強地，只要有一些良心，就不應該在食品中加入一些對人體有害的化學物質，很多食物中被允許有些化學物質，例如，農藥、防腐劑，但這是不得不的作法，所以制訂殘留量的上限，或是訂定最低容許量，來取得平衡點。
但衛生署這次制訂三聚氰胺的標準，過程粗糙，沒有經過長時間的嚴謹討論，就匆促公布，如同鑽檢驗的法律漏洞，目的就是為中國及相關廠商量身訂做一個標準，可以說是某些程度的作假。
