部分縣市希望停課標準應該更嚴格，經過了跨部會會議的討論，中央流行疫情指揮中心考慮到學生受教權益，仍然堅持「325」停課標準。教育部代表甚至說出了重話，如果校方沒有遵守規定，將給予行政處置。
除了停課標準不變之外，疫情指揮中心也宣布新流感的疾病等級也不變。衛生署副署長張上淳指出，新流感絕大多數患者為輕症，疾管局這幾個月來持續監控病毒，發現病毒並無變異，且嚴重性仍並未改變，因此，仍將新流感維持在第四類法定傳染病。
由於全國不少校園班級停課，部分縣市批評，325停課標準過於寬鬆，建議調整為327，也就是3天內，如有2人出現類流感症狀，該班級必須停課7天。
為此，行政院副院長邱正雄前往中央流行疫情指揮中心召開跨部會會議，在考量到學生的受教權益之下，最後仍然維持325停課標準。
張上淳指出，學生活動力強，經常玩在一起，很容易就造成了群聚感染。不過，大多數學童感染新流感後，病毒量在4天內會轉成陰性，且學童經過適當治療，病毒量降低，傳染力也會隨之降低。
至於大專院校是否也比照325停課標準？由於大專院校學生可自由選課，學生們不一定會待在同一間教室上課，增加校園防疫工作。為此，教育部特別邀請了一百多所大專校院代表，開會討論大專院校防疫原則，最後做出決議。
專科學校一年級到三年級，以及大學一年級等學生，因上課班級固定，建議參考「325」原則。如涉及醫學等專業科系的學校，則需另定標準。建議由學校組成專案小組，依照科系特性，研訂班級停課時機與標準。
至於一般大專校院，則建議加強宣導，提醒學生注意自主健康管理。如果確診為流感，就應不要至學校上課，而學校也應建立通報管理機制。未來，疫情如有變化，再依中央疫情指揮中心規定辦理。
教育部體育司司長王俊權表示，如果學校沒有遵照指揮中心規定，自行調整停課天數，不管是公立、私立學校，都將遭受行政處置。
