世界衛生組織（WHO）旗下國際癌症研究中心（IARC）曾將咖啡列為2B可能致癌物質，不過近日發表的研究結果指出，問題不是出在咖啡，而是高溫飲用惹的禍。研究發現，如果經常飲用65℃以上的熱飲，則可能導致食道癌。

WHO最近在權威醫學期刊《柳葉刀》上發表研究報告，來自23個國家的WHO國際癌症研究機構科學家團隊，在審查1000多項研究後做出結論，喝咖啡不太可能導致幾種類型的癌症，包括乳腺癌、前列腺癌和胰腺癌，而且喝咖啡可降低罹患子宮和肝癌的風險。

為此，WHO把咖啡從2B組（可能使人致癌的物質）取出，放到第3組（沒有足夠證據顯示有致癌風險的物質），推翻了先前研究報告，也就是1991年WHO所屬的國際癌症研究機構（IARC）宣布，喝咖啡可能導致膀胱癌。

事實上，近年來，國際大量研究發現，經常喝咖啡可降低罹患心臟疾病、第2型糖尿病、神經系統疾病和一些癌症風險。不過，WHO最新發布的報告中確認喝咖啡和喝茶的另一個風險，那就是喝攝氏65℃的熱飲「可能致癌」，因為食管癌和喝非常熱的飲品有關。

大部份關於咖啡有益健康的證據來自大型流行病學研究，這不能證明其因果關係，但近年來，一些得出喝咖啡有利健康的研究結果，使得許多衛生當局已經認可咖啡是一種健康飲品。